Chuyển đổi số y tế tại các bệnh viện lớn gặp khó khăn do tư duy, quy trình chuyên môn và quản lý chưa thay đổi. Hạ tầng và nền tảng công nghệ chưa thống nhất gây trở ngại kết nối dữ liệu. Đầu tư CNTT cho bệnh án điện tử đòi hỏi chi phí lớn nhưng chưa được tính vào giá dịch vụ khám chữa bệnh.
Triển khai bệnh án điện tử tại các bệnh viện huyện gặp khó khăn về tài chính, nhân lực và hạ tầng kỹ thuật. Cử tri đề nghị hỗ trợ nguồn lực và kỹ thuật để đẩy mạnh ứng dụng bệnh án điện tử. Bộ Y tế đã ban hành văn bản về chuyển đổi số y tế, tạo cơ sở pháp lý cho bệnh án điện tử và hệ thống chăm sóc sức khỏe số.